主任醫(yī)師和副主任醫(yī)師的區(qū)別在于：

1、級別不同。主任醫(yī)師是醫(yī)生職稱中的最高級別，屬于正高級別；副主任醫(yī)師，醫(yī)生職稱的一種，為副高級職稱。

2、晉升條件不同。注冊成為醫(yī)師滿4年，可以考主治，獲得職稱滿5年，有晉升副主任醫(yī)師的資格，一般是評，要論文、課題等等，副主任醫(yī)師滿5年，有晉升主任醫(yī)師的資格。

3、薪資待遇不同，有資格晉升不代表一定能晉升，而且，晉升了不一定有相應(yīng)待遇，有高職低聘一說。